Die ersten Anzeichen sind kleine Pusteln oder anschwellende Knoten, unmittelbar bedingt durch den Insektenstich. Oft sind sie noch kaum zu sehen. In der Regel beginnen die Pferde rasch sich an den betroffenen Stellen zu scheuern. Sie werden zunehmend unruhiger. Durch das ständige Scheuern fallen die Haare aus und es bilden sich offene, nässende Stellen. Diese locken noch mehr Insekten an. So entsteht ein Kreislauf, der sich selbst verstärkt. Die Schweifrübe, der Mähnenkamm und auch der Bauch und die Kruppe, sowie die Ohren und der Hals sind die am häufigsten betroffenen Stellen.

Im Sommer treten diese Erscheinungen nach jedem Ausritt verstärkt auf. Durch die Bewegung beginnen die Pferde zu schwitzen, was die Mücken zusätzlich anlockt. Eine besondere Gefahr geht von sogenannten Sekundärinfektionen aus, die durch Bakterien oder
Pilzsporen verursacht werden können. Diese infizieren die Wunde zusätzlich und belasten unsere Pferde noch stärker. Ein unschöner Kreislauf beginnt, welcher eine zunehmende Beeinträchtigung des Allgemeinzustandes und der Wundheilung nach sich zieht.

Je nach Ausbreitung des Ekzems ist ein Pferd dann oft nicht mehr reitbar.
Auch können Parasiten wie Milben, Läuse und Haarlinge oder einer Infektion mit dem Fadenwurm Oxyuris Equi die Ekzembildung noch verschlimmern. Bei einem chronischen Verlauf erscheint die Haut häufig verdickt, in Falten gelegt und trocken, ein weiteres Merkmal ist Haarverlust.